윤석열 전 대통령의 거부로 조사 과정에서 파행을 겪은 내란 특검이 3시간 30분 만인 28일 오후 5시쯤 조사를 재개했다. 윤 전 대통령 측이 오후 5시쯤 조사실에 들어가면서 점심 식사 이후 중단됐던 피의자 조사가 재개된 것이다. 오늘 오전 9시 56분쯤 특검에 출석한 윤 전 대통령은 오전 10시 14분쯤부터 1시간 가량 조사를 받은 뒤, 점심 식사를 하고 오후 1시 30분부터 이어서 조사를 받을 예정이었는데 오전 조사에 참여했던 박창환 경찰청 중대범죄수사과장(총경)이 윤 전 대통령 법률대리인단으로부터 고발당한 점 등에 대하여 논란이 일어났다. 대리인단 측은 박 총경이 지난 1월 고위공직자범죄수사처(공수처)와 경찰 비상계엄 특별수사단의 체포영장 집행 당시 현장에서 지휘를 한 사실이 있다며 박 총경 등 경찰 관계자들을 서울중앙지검에 고발한 바 있다. 이를 근거로 피고발인 신분인 박 총경이 윤 전 대통령을 조사하는 것이 적절하지 않다고 지적한 것이다. 윤 전 대통령과 변호사들은 점심 식사 이후 조사실에 들어가는 것을 거부했고, 특검팀에 파견된 검사에게서 조사를 받겠다는 입장을 내세웠고, 특검 측은 박 총경이 ‘체포영장 집행 방해 지시’ 의혹 조사를 마무리해야 한다는 입장을 굽히지 않았다.
이를 두고 박지영 특검보는 오후 3시 15분 브리핑을 열어 “수사하는 검사나 사법경찰관을 상대로 고소·고발이 빈번한 현실에서 피고발됐다는 사정만으로 업무에서 배제할 수는 없다”며 “사실상 형사 사법 절차를 마비시키는 것”이라고 비판했다. 이어 “전직 대통령이라고 해서 경찰 수사를 받지 않으리라는 법은 없다”며 “경찰 제도 자체를 인정하지 않는 것과 마찬가지”라고 했다. “허위 사실로 수사 진행을 방해하는 것에 대해서는 단호하게 대처하겠다”고 했다.

경찰도 이날 “박 총경이 불법 체포를 지휘한 사람이라는 윤 전 대통령 대리인단 측의 주장은 사실이 아니다”라며 “박 총경은 윤 전 대통령에 대한 1차 체포영장 집행 시 현장에 가지 않았고, 2차 체포영장 집행 시에는 김성훈 전 대통령경호처 차장과 이광우 전 경호본부장에 대한 체포영장 집행을 위해 현장에 갔다”고 설명했다.

내란 특검 측은 28일 오후 7시 브리핑을 열고 “윤석열 전 대통령의 조사는 오후 4시 45분쯤 재개됐다”며 “오전에 조사하던 체포영장 집행 방해 지시 혐의와 비화폰 서버 삭제 지시 혐의는 조사하지 못했다”고 했다. 윤 전 대통령 측이 요구한 대로 부장검사 2명이 참여해 12‧3 비상계엄 당시 국무회의 및 외환 혐의에 대한 조사는 이뤄졌다고 한다.

박지영 특검보는 “윤 전 대통령 측이 조사를 거부했기 때문에 김정국(사법연수원 35기)·조재철(36기) 두 부장검사가 2회차 조사를 시작했다”며 “오전에 조사한 피의자 신문 조서에 윤 전 대통령이 서명하지 않았다”고 했다. 조사를 마친 뒤 피의자가 조서에 서명하지 않으면 향후 재판에서 증거로 쓸 수 없다. 다만 박 특검보는 “조사 자체로 의미가 있고, 일부 활용될 곳이 있다”고 했다. 두 부장검사는 外患 혐의를 비롯해 국무회의 의결 과정 전반, 국회의 비상계엄 해제 시도 방해 등을 조사했다고 한다.

특검팀은 조사할 분량이 많아 추가 소환이 불가피하다는 입장이다. 이날 조사의 진도에 따라 소환 일정을 정할 계획이다. 한편 조사실 내에서 특검팀 측은 윤 전 대통령을 ‘대통령님’으로 부르고 있다고 한다. 다만 조서에는 피의자로 기재된다는 게 특검 측 설명이다.