대한민국의 헌법과 법치주의에 반역한 최초의 대통령으로 기록될 가능성도 있는 김대중 시절의 국정원장중 林東源은 연구대상이다. 그는 정몽헌의 현대그룹이 김대중 정권의 지시에 따라 8억 달러 이상의 비자금을 조성하여 민족반역자 김정일의 對南테러공작기관 조광무역상사 계좌에 입금시키는 반역행위를 저지를 때 국정원 조직을 동원하여 이를 지원했다. 송금 과정을 국정원이 주도했을 가능성이 있다. 이 송금 과정에 실무책임자로 간여한 국정원의 핵심 간부는 김대중의 통일방안은 김일성의 연방제를 모방한 親北的인 것이라는 평가보고서를 썼던 인물이기도 하다.

그런 反共的 인물이 親北的 대통령과 국정원장 아래서 김정일의 핵개발, 무기개발, 對南공작을 돈으로 지원하는 반역행위를 하게 된 것은 국정원이란 조직이 정보부 시절의 체질에서 크게 벗어나지 못했다는 증거이다. 즉, 권력기생체질 그대로 권력에 기계적으로 봉사함으로써 조국과 헌법에 위반되는 명령일지라도 상관의 명령이면 무조건 실천하고 본다는 이야기이다.

만약 이런 조직을 親北(親김정일) 국정원장이 장악하게 된다면 이 조직이 지닌 막각한 정보력과 비밀공간, 정부 부처 감시 능력, 대통령 직보 능력, 북한 공작기관과의 커넥션을 활용하여 국정원을 親김정일쪽으로 끌고가 대한민국을 망하게 하는 데 결정적 역할을 할 수도 있다는 이야기가 된다.

10.26 사건 때 김재규가 대통령을 시해한 직후 육군본부 벙커로 가지 않고 정보부로 갔더라면 거기에 지휘부를 두고 국정원 조직을 동원하여 대통령 암살을 비밀에 붙인 채(또는 차지철을 범인으로 조작한 다음) 정권을 잡을 수 있었다는 설이 유력하다.

前身인 정보부 시절까지 거슬러오르면 국정원은 대통령 시해, 김정일에게 핵개발-對南공작비 상납 등 두 번의 반역행위에 가담했다. 이 민족사적 범죄행위보다 더 위험한 음모에 국정원이 이용되지 않으려면 구성원 모두가 '헌법에 위반되는 불법 부당한 명령은 거부하고 이를 검찰에 고발해야 한다'는 복무수칙을 법제화하는 것이다.