인터넷 사이트 ‘시스템클럽’을 운영하는 지만원 씨가 <5.18진실 놓고 김대중의 국정원과 암거래한 조갑제>, <조갑제 반론에 답한다> 등의 글에서 사실 관계를 확인하지 않고 趙甲濟(조갑제) 기자를 명예훼손한 부분에 대해 바로 잡았다. 지만원 씨는 6월4일 <조갑제 기자에 대한 글 바로 잡습니다>라는 글을 올려 趙甲濟 기자가 지적한 ‘사실과 다른 부분’에 대해 수정하고, 사이트 회원들에게도 옮긴 글을 수정해달라고 요청했다.

지氏는, 조갑제 기자가 1998년 7월호 월간조선 발행 당시 편집장의 직위에 있지 않았음에도 ‘국정원과 趙甲濟 편집장이 공모하여 광주사태 관련 내용을 소멸시켰다’는 내용의 글을 쓴 데 대해 <당시의 편집장이 조기자였다고 판단했지만, 조기자가 이것이 사실이 아니었다고 구체적으로 해명하였기에 그 해명을 액면 그대로 수용하고자 합니다. …일단 제가 쓴 글들의 내용 중 조 기자가 해명한 부분에 대해서는 바로 잡을 것입니다. 여러분들께서도 이점 바로 잡아 주시고, 번거로우시더라도 다른 사이트에 옮기신 글에 대해서도 손질해 주시기 바랍니다>라고 밝혔다.

황장엽 前 북한노동당 비서를 조갑제 기자가 ‘관리했다’는 것과 ‘월간조선은 조갑제의 왕국이었다’는 내용 또한 바로 잡았다.

<제가 조기자가 황장엽씨를 관리하고 있었다고 표현한 것은, 읽는 사람들에 따라 ‘부적절한 표현’으로 이해할 수 있다는 생각이 들어, 이 부분 역시 바로 잡아주시기 바랍니다. …조갑제 기자가 다시 편집장으로 들어오기 ‘한 달 전’의 ‘서희건’씨는 바지일 것이고 사실상 조갑제가 편집권을 가지고 있었지 않았겠느냐는 취지의 제 표현은 제 판단일 뿐입니다. 조기자가 이 판단 부분이 사실과 다르다 해명하니 이 부분도 바로 잡아 주시기 바랍니다.>

趙甲濟 기자는 조갑제닷컴에 게재한 <용서할 수 없는 지만원氏의 게으름>, <지만원氏가 빠진 ‘변명의 수렁’> 글에서 지만원 씨의 사실 왜곡을 지적한 바 있다.